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次世代シーケンサー受託解析サービス
データ解析受託サービス
概要
次世代シーケンサー(NGS)で読み取った大量のDNA(RNA)配列を意味のあるデータにする計算を行います。
シーケンスデータは、単純な塩基配列情報となっており、必ず大量計算が必要となってきます。
本サービスでは確立されたスタンダードな解析に限らず、様々な手法を用いて目的データを取得するお手伝いをさせていただきます。
特徴
PictBioサービスではサポートサービスに力を入れております。
サービスフロー
解析の提案
お客様の研究目的に合わせたサービスの提案、解析手法の作成を行います。
解析の専門用語など、お気軽にご質問いただけますので初心者の方にも安心です。
新しい論文の手法を使うなどで調査が必要であれば、弊社にご依頼いただくことも可能です。
こんな時、PictBioなら解決!
- どのシーケンサー使えばいいの?
- データ解析はどうすればいいの?
- この論文と同じことがしたい
専属の解析技術者が対応
データ解析の節目でデータの状態を確認、ご報告いたします。
シーケンスデータに問題が見つかった場合、解決方法の検討と調査を行い、提案いたします。
前述の解決方法で再解析、軌道修正が可能のため、問題を残したまま後流解析へ進むことを防げます。
これにより、意味のある結果を確実・効率的に得ることができます。
こんな時、PictBioなら解決!
- コンタミしちゃった
- インデックス配列が残ってる
- キメラ配列が邪魔
内容の解説
納品物の解説を行います。
結果の解釈など、納品物の疑問点・不明点をご質問いただけます。
担当者が気になった点や、データの活用アイデアがあればご報告いたします。
こんな時、PictBioなら解決!
- この列の計算結果は何?
- マッピング率が低い気がする
- クオリティの値はどう見ればいい?
サービス例
解析の種類
- 新規ゲノム配列作成
- 遺伝子予測
- 遺伝子発現量計算
- トランスクリプトームアセンブル
- Whole Genome
- Exome解析
- 変異検出
- CNV検出
- 構造変異検出
- ChIP-Seq
- BS-Seq(Bisulfte sequence)
- 環境ゲノム解析
- 細菌叢解析
- ショットガンメタゲノム
シーケンス解析受託サービス + データ解析受託サービス
PictBioサービスにてシーケンス~データ解析まで一括でご依頼いただけます。
自由なプラン設計
PictBioではHPに掲載しているサービスの他、ご希望に応じたプランの作成が可能です。
年間サポート
シーケンサーは持っているけど活用できていないといった方へおすすめ。
外部の方からサンプルを受け付けてどんどんシーケンサーを回すのに、データ解析が付いていると安心です。
弊社のスタッフが月1回訪問し、ディスカッションによりデータ解析の計画~結果報告までサポートします。
チケット制
データ解析をたくさん実施されたい方におすすめ。
1か月分のデータ解析チケットをセットでご購入いただき、好きなタイミングでご利用いただけます。
ご依頼のフロー
Step1 : ご依頼、参考見積 |
価格、お見積よりご依頼ください。送付いただいた内容をもとに、参考見積と仕様書を作成いたします。または当社の東京オフィスにお電話ください(番号はこちら)。その際、「次世代シーケンサーデータ解析の依頼」でのご連絡の旨をお伝えいただくと、スムーズです。 |
Step2 : ヒアリング |
ご依頼の内容に関して、解析内容の詳細をヒアリングをさせていただきます。 |
Step3 : お見積り |
ヒアリングの内容をもとに、再度お見積と仕様書を作成いたします。 書類はメールにてお送りさせていただきます。その際に注文書・必要送付物リストも同封させていただきますので、同意いただけた場合は、注文書に必要事項をご記入後同じくメールにて pictbio@axiohelix.com まで送付ください。 |
Step4 : シーケンスデータ送付 |
シーケンスデータ(FASTQ形式など)を当社所有のサーバーにて解析依頼いただいた場合、CDや外付けHDDなどで送付いただきます。お送りいただいたメディアは終了後、お返しいたします。 お持ちのサーバー等で解析を行われたい場合は、リモートアクセスでのサービスも可能になります。その場合、外部アクセスが可能、かつ、解析に必要なスペックを満たしていることが必要となります。 |
Step5 : 解析・結果報告 |
シーケンスデータ確認後、解析をスタートいたします。各解析段階や気になる結果が出た時など、報告が必要なタイミングでご連絡させていただきます。報告や解説に不明点等ございましたら、お気軽にご連絡ください。 作業量に余裕がある場合は、結果を交えての解析、プロットの作成など、契約の範囲内に収まる追加の依頼を承ることが可能です。 全解析期間の目安としましては、シーケンスデータ確認後、解析・報告のやり取りを含めて1~3カ月が多くなっております。 |
Step6 : 最終納品 |
解析結果をまとめたデータを作成し、お渡しいたします。基本的に仕様書に沿ったデータが対象となります。お預かりしたメディア等も、同時に返却いたします。 |
Step7 : データの除去 |
お預かりしたデータ等は1カ月間、保管いたします。1カ月がたちましたら、当社サーバーから削除いたします。 |
価格、お見積
以下のフォームよりお問い合わせください。
これらの情報があるとスムーズです。
- サンプルの種類 (例:マウス、正常と異常)
- サンプル数
- 配列解析のシーケンサーの機種やアプリケーション (例:Illumina MiSeq、250pb長、ペアエンド)
- 配列解析の方法 (例:ChIP-Seq解析、正常と異常で比較する)